Cette église fut construite de 1748 à 1751 à la place d’une petite chapelle.

Déjà paroissiale au XIIè siècle, son église a été maintenue succursale par décret du 30 sept. 1807 (fête patronale l'Assomption). Sa reconstruction sur l’emplacement de l’ancienne église connut de nombreux rebondissements.

L'église originelle, construite en 1598, était au Magny-de-Fresse (on en parle plus longuement ci-après). Elle fut démolie en 1748. Son emplacement se situe à "La Grande Croix du Magny".

La croix de l'ancien cimetière domine les quelques maisons du lieu dit. Sur un linteau de fenêtre de l'une d'entre elles on peut lire la date "1703" ainsi que plusieurs initiales. A n'en pas douter, cette maison a vu de près les vicissitudes vécues par cette église tant disputée. Autre trace de ce lieu de culte, une pierre creusée en forme de bénitier, scellée sur le dessus d'un muret. Enfin le grand calvaire situé au centre du hameau.

11 novembre 1745 : requête à Monseigneur l'Intendant pour construire une nouvelle église à Fresse malgré le refus des habitants du Magny, de la Combe et du Renard (trop coûteux il suffit de quelques réparations) en vue de la rapprocher de la maison presbitérale de Fresse. L'église de leur paroisse (Magny) : "exposée à être volée, … chemins impraticables 8 mois de l'année, ruisseaux, fonte des neiges, rivières en torrent dangereux à passer, maison presbitérale éloignée d'une demie lieue, imposant les malades à mourir sans secours spirituels, les femmes enceintes, les enfants et les vieillards ne pouvant profiter des instructions qui se font dans leur église ……".

Une autre requête (12 juillet 1746) des habitants environnant le village de Fresse se trouve dans les archives de St-Barthélémy dont ils dépendaient (bien que reportée sur le registre en 1786, la requête d'origine est bien de 1746) :

"extrait des registres du parlement :

requete des habitants du Magny de Fresse, de la Combe et du Renard mettant en avant que "depuis plusieurs siècles il y a sur leur territoire une église succursale en bon état dépendante de l'église paroissiale de St Barthelemy les Melisé. Cette succursale est batie dans un endroit commode et au centre des villages de fresse, de la Combe et du Renard ….celui qui y fait les fonctions de vicaire actuellement ayant fait quelques acquisitions de fond au lieu de fresse a fait gouter aux habitants de ce lieu un projet de translation de cette succursale, il a mandié une délibération de cette communauté qu'il a fait signer de porte en porte ….le diocésain en ordonnant la construction d'une église ailleurs en permettant la destruction de la première qui est solide boulverse l'ancien état de la paroisse, il fait plus, il impose en meme temps une charge aux paroissiens en les jettant dans de grands frais pour la construction d'une nouvelle église et cela sans savoir s'ils sont en état de supporter cette dépense ….les suppliants insistent encore à la surséance de l'éxécution de ce décret (du trois février dernier) ….

Fait en parlement de Besançon le douze juillet mil sept cent quarante six".

 19 juillet 1746 : autre requête, reprenant à quelques mots près celle du 12 juillet précédent, des habitants du Magny, de la Combe et du Renard au Parlement contre cette translation. "Une quantité de personnes ne pourront se rendre à cette église. Il suffirait d'agrandir par des collatéraux et agrandissement de la nef ce qui coûterait une dépense modique".

S'en suivirent de nombreux procès et interventions au Parlement de Besançon jusqu'en 1748.

Plusieurs saisies de meubles furent engagés pour payer les procès.

Enregistrement de l'arrêt du Parlement du 11 août 1747 :

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